Vývoj prognostického modelu sepsy na základe génov spojených s črevnou mikrobiotou a identifikácie potenciálnych cieľov

Návrat na zoznam správ

Zdroj: Frontiers Medicine

Originál: https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmed.2026.1766359...

Publikované: 2026-03-05T00:00:00Z

Vedci vyvinuli prognostický model GMGscore pre sepsu na základe 6 génov spojených s črevnou mikrobiotou (CYP1A2, FFAR2, IL4R, MUC1, RORA, ASPM), ktorý dosiahol vysokú presnosť (AUC = 0,903 v tréningovom sete GSE65682 a AUC = 0,901 vo validačnom sete GSE95233). Model vznikol analýzou rozdielne exprimovaných génov z databázy GEO (GSE154918), pretiahnutých s 248 génmi z databázy GutMGene, čím identifikovali 34 relevantných génov obohatených o dráhy ako zápalové ochorenie čriev a signalizácia IL-17. Vysoké GMGscore súviselo so zlým prežitím, zvýšenou degranuláciou neutrofilov a zníženým ich počtom. Kľúčový gén RORA bol v sepse konzistentne potlačený, s najvyššou diagnostickou hodnotou (vysoká AUC), exprimovaný najmä v efektorových T bunkách a NK bunkách, kde pozitívne koreloval s infiltráciou CD8+ T buniek (R = 0,419) a NK buniek (R = 0,352). Virtuálny knockout RORA znížil expresiu cytotoxických génov. Molekulárne dokovanie ukázalo stabilnú väzbu RORA s metabolitmi od Collinsella (kyselina citrónová, sedoheptulóza, kyselina trikarballylová). Tieto zistenia potvrdili RT-qPCR v krvi pacientov a scRNA-seq údaje (GSE167363).