Milióny detí užívajú melatonín na pomoc pri spánku, no lekári varujú pred jeho používaním. Veľký prehľad štúdií potvrdil jasné výhody melatonínu pre deti s ochoreniami ako autizmus a ADHD, kde skracuje čas zaspávania o najmenej 30 minút. Pre typickú detskú nespavosť existuje oveľa menej údajov o účinnosti. Pozorovacie štúdie zaznamenali nárast predpisovania, predĺžené užívanie – podľa údajov z roku 2019 u 85 % detí vo veku 0-4 rokov po 2 mesiacoch a 40 % dlhšie – a rastúce náhodné predávkovania u malých detí. Melatonínové doplnky často majú nesprávne označené dávky. Odborníci odporúčajú používať ho opatrne, len v kombinácii s overenými behaviorálnymi spánkovými stratégiami a pod lekárskym dohľadom. Dlhodobé údaje o bezpečnosti a účinkoch na správanie chýbajú, najmä u detí s typickým vývojom.