U chronickom ochorení obličiek (CKD) indukovanom adenínom u myší sa zvyšuje hladina uremického toxínu indoxyl sulfátu, čo vedie k zvýšenej expresii génu pre indukovateľnú syntázu dusíka oxidu (iNOS) v sliznici.[1] To spôsobuje nárast nitrátov v čreve, ktoré podporujú rast Escherichia coli prostredníctvom nitrátovej respirácie.[1] E. coli produkuje indol, z ktorého pečeň vytvára indoxyl sulfát, čo urýchľuje progresiu CKD.[1] Fekálna mikrobiota pacientov s CKD produkuje pri anaeróbnom kultúre viac indolu ako u zdravých osôb, ale len v prítomnosti nitrátov.[1] Prítomnosť nitrátov zvyšuje produkciu indolu E. coli a zhoršuje poškodenie obličiek u myší s CKD.[1] Inhibícia iNOS zmiernila túto škodlivú cestu u myší.[1] Pri CKD sa v stolici zvyšuje hojnosť Enterobacteriaceae, čo súvisí s týmito mechanizmami.[1]