Sepsa je život ohrozujúca orgánová dysfunkcia spôsobená dysregulovanou reakciou hostiteľa na infekciu. Podľa Global Burden of Disease Study postihuje viac ako 50 miliónov ľudí ročne a spôsobuje približne 5,3 milióna úmrtí, s mierou úmrtnosti od 20 % do 50 % podľa populácií a zdravotníckych zariadení. Črevná mikroflóra je najväčší mikrobiálny ekosystém v tele, udržiava integritu črevnej bariéry, imunitnú homeostázu a metabolickú rovnováhu. Podieľa sa na patogenéze, progresii a výsledkoch sepsy moduláciou imunitných reakcií, produkciou kľúčových metabolitov a osami orgánov čreva. Článok skúma dysbiózu črevnej mikroflóry vyvolanú sepsou, molekulárne mechanizmy ovplyvňujúce imunitné a metabolické poruchy a poškodenie orgánov. Hodnotí klinický potenciál biomarkerov mikrobiómu, pokroky v terapiách ako mikrobiotická/prebiotická výživa, antibiotiká a fekálna transplantácia. Cieľom je analyzovať nedostatky výskumu a poskytnúť základ pre individualizovaný manažment sepsy založený na mikrobióme.