AlphaGenome identifikuje hlbokú intrónovú variantu v rodine s PLA2G6-asociovanou neurodegeneráciou: Zatvárame diagnostickú medzeru v zriedkavých genetických chorobách

Článok opisuje prípad dvoch súrodencov s PLA2G6-asociovanou neurodegeneráciou (PLAN), ktorí mali symptómy vrátane raného parkinsonizmu, neuropsychiatrických príznakov a autonómnej dysfunkcie. Napriek predchádzajúcim genetickým testom vrátane klinického exómového sekvenovania a dlhočítajúceho sekvenovania bola identifikovaná iba jedna heterozygótna variant. Pomocou AI modelu AlphaGenome boli analyzované 91 nekódujúcich variantov v oblasti PLA2G6 génu. Model identifikoval hlbokú intrónovú variantu (c.2034+355G>A), ktorá vytvárajúca kryptický akceptorový miesto pre spájanie a mohla by viesť k zaradeniu 160-bp kryptického exónu. Predpovede špecifické pre tkanivo naznačili, že abnormálne spájanie by bolo detekovateľné v krvi, čo bolo potvrdené RNA-seq analýzou. Táto analýza dokončila diagnózu takmer dve desaťročia po začiatku symptómov a demonštruje užitočnosť sekvenčno-funkčných modelov pri diagnostike zriedkavých genetických chorôb.