Rozšírenie nástrojov pre objavovanie cieľov v onkológii a znižovanie rizík

Článok sa zaoberá rozšírením možností identifikácie génov, na ktorých závisia rakovinové bunky, čo je kľúčové pre vývoj cielených terapií. DepMap a Open Targets Platform sú veľké kolaboratívne iniciatívy, ktoré pomocou CRISPR-Cas9 a RNA interferencie vypínali gény v 900 rakovinových bunkových líniách a sledovali, ktoré vypnutia znížili životaschopnosť buniek. Hoci sú tieto databázy užitočné, majú nedostatky – nepokrývajú komplexné poruchy a chýba im interpretovateľnosť mechanizmov pôsobenia. Virtuálne testy využívajúce strojové učenie modelujú rakovinové bunky na predpovedanie genetických závislostí a identifikáciu syntetickej lethality. V príklade s PARP inhibítormi bolo identifikovaných 13 potenciálnych biomarkerov, z ktorých osem bolo validovaných in vitro a dva sú teraz zaradené v klinických paneloch. Približne 40 % pacientov s BRCA mutáciami nereaguje na PARP inhibítory, čo naznačuje potrebu lepších predikčných metód.