Spracovanie rádiologických snímok TCIA pre AI a rádiomiku

Bol vyvinutý štandardizovaný a reprodukovateľný rámec pre predspracovanie dát z počítačovej tomografie (CT) z viacerých inštitucionálnych archívov, ako je The Cancer Imaging Archive (TCIA). Tento rámec umožňuje konzistentné rádiomické a umelointeligentné (AI) analýzy. Bol demonštrovaný na heterogénnom súbore dát pacientov TCGA-KIRC z TCIA, ktorý sa vyznačoval rôznymi protokolmi akvizície a nekonzistentnou kvalitou. Navrhovaný modulárny proces zahŕňa filtrovanie sérií, konverziu DICOM-to-NIfTI, harmonizáciu orientácie a normalizáciu rozstupov voxelov. Ďalej zahŕňa orezanie a normalizáciu intenzity, integráciu segmentácie a validáciu metadát. Tento systém štandardizuje obrazové dáta do analýzy pripravených objemov s konzistentnou geometriou a distribúciou intenzity. Tým sa znižuje nebiologická variabilita, ktorá môže nepriaznivo ovplyvniť stabilitu rádiomických vlastností a výkon modelu. Hoci bol demonštrovaný na TCIA, rámec je zovšeobecniteľný aj na iné heterogénne obrazové súbory.