Odhalenie fitness endemicky cirkulujúcich kmeňov vírusu Zika

Vírus Zika (ZIKV) je arbovírus, ktorý desaťročia endemicky cirkuluje v Ázii a zvyčajne spôsobuje len málo symptómov. Veľký výbuch v Južnej Amerike v roku 2015 však odhalil vážne riziko kongenitálneho syndrómu Zika u novorodencov infikovaných matiek. Výskumníci analyzovali 107 sekvencií z Thajska zbieraných počas 18 rokov (2006-2023) a identifikovali šesť lineáží cirkulujúcich postupne v populácii. Našli 15 mutácií definujúcich lineáže, vrátane štyroch známych mutácií zvyšujúcich fitness a dvoch substitúcií v UTR oblasti. Lineáž, ktorá sa objavila v Južnej Amerike, bola evolučne spojená s najvyššou fitness lineážou v Thajsku a obsahovala sedem definujúcich substitúcií získaných počas endemickej cirkulácie. Po globálnej pandémii sa endemický ZIKV v Thajsku naďalej vyvíjal s novými mutáciami a zvýšenou fitness.