Multiplex RT-PCR na sledovanie variantov SARS-CoV-2 v podmienkach s obmedzenými zdrojmi: validačná štúdia na Kube

Vedci vyvinuli a overili multiplex RT-PCR test na rýchlu a ekonomickú detekciu kľúčových mutácií spojených s variantmi SARS-CoV-2. Test pozostáva z dvoch multiplex zmesí zameraných na osem mutácií v génoch ORF1a a Spike. Validácia ukázala 100% klinickú citlivosť medzi vzorkami s platnými výsledkami (41 z 42 vzoriek), limit detekcie 5,7 log10 IU/mL a 100% analytickú špecifickosť voči 32 nekovídovým respiračným patogénom. Šesť z ôsmich oligonukleotidových sád vykazovalo viac ako 96% zahrnutie, zatiaľ čo dve sady mali zníženú zahrnutie (94,03% a 90,14%). Test umožňuje priamu identifikáciu hlavných variantov (Alpha, Beta, Gamma, Delta, Omicron) a nepriamu detekciu viacerých ďalších variantov. Táto metóda predstavuje rýchlu, citlivú a nízkonákladovú alternatívu na sledovanie variantov SARS-CoV-2 na Kube a v podobných podmienkach.