Priestorová transkriptomika prehodnocuje bunkovú mikrookolie melanómu spojivky

Melanóm spojivky je vzácny druh rakoviny s potenciálne vysokou mierou recidívy, ktorého mechanizmy progresie a molekulárne charakteristiky sú málo známe. Výskumníci analyzovali 12 vzoriek tkaniva z troch pacientov pomocou priestorovej transkriptomickej analýzy Xenium. Analýza zloženia ukázala, že melanóm znižuje počet fibroblastov a epitelových buniek, zatiaľ čo melanocyty sa množia. Diferenciálna expresia génov odhalila jasný vzor progresie choroby od zápaľu cez reštruktúráciu buniek až po progresiu nádoru a malignitu. Priestorová transkriptomika umožňuje porovnávať priestorovo relevantné údaje, ktoré sa ťažko oddeľujú tradičnými metódami. Štúdia identifikuje kandidátov na biomarkery progresie, ktoré by mohli v budúcnosti slúžiť ako objektívne diagnostické a prognostické nástroje.