IgA nefropatia je autoimunitné ochorenie obličiek spôsobené zlyhaním mukóznej tolerancie, abnormálnou glykozylációou IgA1 a tvorbou autilátok proti glykánom. Hlavným patogénnym procesom je usadzovanie komplexov galaktózy-deficitného IgA1 v meziach glomerule, pričom sa zistilo, že aj IgA2 prispieva k ochoreniu. Komplementový systém sa v IgA nefropatii aktivuje prostredníctvom klasickej, lektínovej a alternatívnej cesty, pričom alternatívna cesta sa môže aktivovať nezávisle. Komplementová aktivácia v meziach glomerule vedie k poškodeniu endotelu, leukocytov a podocytov, čo v konečnom dôsledku spôsobuje proteinúriu, sklerózu a fibrózu. Komplementové biomarkery korelujú so špecifickými histologickými zmenami. Nové terapie zacielené na jednotlivé časti komplementového systému (MASP-2, faktor B, C5aR a C5) by mali doplňovať optimalizovanú podpornú liečbu a moduláciu IgA osi.