Mimo červeného komplexu: Objavenie nových markerov odhalilo nové taxóny spojené s periodontitídou a umožnilo neinvazívnu diagnostiku pomocou strojového učenia

Periodontitída postihuje viac ako 1 miliardu ľudí na svete, ale jej diagnostika sa opiera o klinické merania, ktoré nezachytávajú základnú mikrobiálnu dysbiózу. Výskumný tím analyzoval 341 vzoriek mikrobiómov z nadďasňa a podďasňa (218 s periodontitídou, 123 zdravých) z deviatich krajín pomocou referenčne nezávislej metódy MetaMarker. Identifikovali 2 142 významných markerov, z toho 1 999 spojených s periodontitídou a 143 so zdravím, pričom 128 markerov (6,4 %) bolo nových, vrátane neskultivovaného rodu Paludibacteraceae. Modely strojového učenia, najmä XGBoost a gradient boosting, dosiahli na externých validačných súboroch presnosť AUC=0,96. Kompaktný panel 20 markerov z piatich taxónov úspešne reprodukoval výsledky úplného súboru. Táto neinvazívna metóda diagnostiky má potenciál pre klinickú aplikáciu.