Centrum pre kontrolu a prevenciu chorôb (CDC) založilo v roku 2020 Národný systém dohľadu nad odpadnými vodami na detekciu a kvantifikáciu RNA SARS-CoV-2 v odpadných vodách v Spojených štátoch. Systém sa následne dramaticky rozšíril z nezávislých miestnych snáh na koordinovaný národný systém. Dohľad nad odpadnými vodami je jedinečný tým, že nezávisí od toho, či majú osoby príznaky, prístup k zdravotnej starostlivosti alebo klinické testy. Môže slúžiť ako systém včasného varovania a detekuje malé zmeny v prenosoch infekčných chorôb v komunite. CDC v súčasnosti prijíma údaje z približne 1 500 lokalít zberu vzoriek odpadných vôd v celých Spojených štátoch, vrátane všetkých 50 štátov, 7 území a niektorých kmeňových komunít. Systém sa spolieha na partnerstvo medzi verejnými zdravotníckymi úradmi, akademickými výskumníkmi, komerčnými laboratóriami a operátormi odpadných vôd.