Alogetná transplantácia hematopoetických kmeňových buniek (allo-HSCT) je procedúra, pri ktorej pacient dostane zdravé krvotvorné kmeňové bunky od geneticky zhodného darcu na nahradenie svojej poškodenej kostnej drene. Akútna choroba štepov proti hostiteľovi (aGVHD) je vážna komplikácia allo-HSCT, ktorá sa vyskytuje v prvých 100 dňoch po transplantácii a postihuje najmä gastrointestinálny trakt, čo spôsobuje hnačku, bolesti brucha a krvácanie. Prvotnou liečbou je kortikosteroidná terapia, ale steroidom rezistentná aGVHD má zlú prognózu a limitované možnosti liečby. Incidencia aGVHD sa časom znížila – kumulatívna incidencia stupňa II až IV klesla z 47 % pred rokom 2000 na 16 % po roku 2010. Kondicionačné režimy pred transplantáciou spôsobujú poškodenie sliznice a narušenie črevnej bariéry, čo vedie k dysbiózе – nerovnováhe črevnej mikrobioty. Transplantácia fekálnej mikrobioty (FMT) zahŕňa podanie spracovaného vzorky stolice od zdravého darcu s cieľom obnoviť črevnú mikrobiotu a jej ochranné funkcie.