Hygienici v Českej republike evidujú celkom 8 lokalít so zákazom kúpania a 10 označených ako nevhodných na kúpanie. S pokračujúcou rekreačnou sezónou sa na niektorých vodných plochách zvyšuje výskyt siníc. Medzi lokality so zvýšeným výskytom siníc patria napríklad vodná nádrž Slezská Harta, Máchovo jazero a ďalšie miesta v rôznych krajoch. Na niektorých lokalitách, ako napríklad na Orlickej preehrade v Podolsku, platí zákaz kúpania kvôli nadlimitnému množstvu siníc a hrozí akútne poškodenie zdravia. Hygienici odporúčajú zvýšenú opatrnosť najmä citlivým skupinám obyvateľstva a sprchovaní sa čistou vodou po kúpaní. Kvalita vody sa líši podľa regiónu, pričom niektoré oblasti majú vynikajúcu kvalitu vody bez problémov.