Genomický foundation model-derived disruption profiling spája somatické mutácie s biológiou rakoviny a klinickými výsledkami

Výskum skúmal, ako somatické mutácie v DNA môžu spôsobiť čiastočné narušenie génov s biologickými a klinickými dôsledkami. Vedci použili modely AlphaGenome a AlphaMissense na analýzu mutácií u 8 800 pacientov s 33 typmi rakoviny z databázy The Cancer Genome Atlas. Zistili, že opakujúce sa mutácie na hotspot pozíciách mali výraznejšie predpokladané účinky na úrovni proteínov, zatiaľ čo ostatné mutácie vykazovali väčšie regulačné účinky. Vytvorili profily narušenia génov na úrovni pacienta, ktoré odrážali typ tkaniva, typ rakoviny a stav mikrosatelitnej nestability. Medzi pacientmi bez opakujúcich sa hotspot mutácií v konkrétnom géne rakoviny bola vyššia predpokladaná disrupcia spojená s celkovým prežitím, pričom najsilnejší signál bol pozorovaný pri dostupnosti chromatínu. Výsledky naznačujú, že narušenie génov má kontinuálny, multidimenzionálny charakter presahujúci diskrétne spúšťače rakoviny.