Metagenomické sekvenovanie bronchoalveolárnej laváže v ranom období po transplantácii pľúc: Pilotné porovnanie s mikrobiologickou kultiváciou

Konvenčná kultivácia bronchoalveolárnej laváže (BAL) má obmedzenú citlivosť u príjemcov pľúcnych transplantátov. Metagenomické sekvenovanie BAL ponúka identifikáciu patogénov nezávislú od kultivácie. Štúdia porovnávala konvenčnú kultiváciu s metagenomickým sekvenovaním (Karius Focus BAL a Oxford Nanopore) u 19 dospelých príjemcov pľúcnych transplantátov, pričom analyzovala 33 vzoriek BAL. Karius detegoval patogény v 19 z 33 epizód (58%), zatiaľ čo konvenčná kultivácia len v 8 z 33 epizód (24%). V 16 prípadoch, kde Karius detegoval patogén, ktorý kultivácia nezachytila, bolo 8 z nich prediktívnych, čo znamená, že rovnaký organizmus bol neskôr potvrdený ako príčina invazívnej infekcie, vrátane fatálnej pneumónie spôsobenej Pseudomonas. Kvantitatívna záťaž mikrobiálnej bezbunkovej DNA (mcfDNA) pozitívne korelovala s alveolárnymi zápalovými biomarkermi ako celkový proteín, IL-6 a sST2. Záverom, metagenomika mcfDNA z BAL identifikovala klinicky relevantné patogény, ktoré konvenčná kultivácia nezachytila, a jej kvantitatívny signál koreloval so zápalovými mediátormi.