Výskumníci skúmali mikrobiálne zloženie odpadných vôd v súvislosti s počtom prípadov COVID-19. Zistili, že určité baktérie sú spojené s počtom prípadov, vrátane druhov ako Blautia, Dorea a Akkermansia, ktoré sa počas infekcie SARS-CoV-2 znižujú, a patobionty ako Ruminococcus gnavus a Ruminococcus torques, ktoré sa zvyšujú. Prediktívne modely ukázali, že kombinácia baktérií a kópií génu SARS-CoV-2 je účinná na odhad súčasných prípadov. Zmeny v mikrobióme spôsobené COVID-19 sú detekovateľné v odpadných vodách aj v oblastiach s nízkou populáciou. Výsledky naznačujú, že mikrobióm odpadných vôd môže byť užitočný na monitorovanie verejného zdravia pri COVID-19 a potenciálne aj iných infekčných chorôb.