Parkinsonova choroba je spojená s opakovanými zmenami v zložení črevného mikrobiómu a dôkazmi o poškodení črevného bariéry. Meta-analýza zahŕňala 33 štúdií s 1 588 pacientmi s Parkinsonovou chorobou a 1 449 zdravými kontrolami. Výskum preukázal zníženie baktérií produkujúcich mastné kyseliny s krátkym reťazcom (Prevotellaceae, Faecalibacterium a Lachnospiraceae) a zvýšenie iných druhov (Akkermansia, Bifidobacteriaceae a Christensenellaceae). Zvýšené hladiny fekálneho kalprotektínu a zonulínu naznačujú nízkoúrovňové črevné zápaľové procesy a poškodenie črevného epitelu. Pacienti s tzv. črevným fenotypom choroby vykazovali potenciálne výraznejšie zmeny mikrobiómu ako pacienti s mozgovým fenotypom, hoci táto pozorovaná je zatiaľ založená na obmedzenom počte štúdií. Výsledky podporujú biologicky vierohodný podiel črevných mechanizmov na patofyziológii choroby.